1樓:匿名使用者
巨集基因組分析就bai是分析某一環境中所du有生物的核酸資訊zhi 全基因組關
dao聯分析就是測
回序資料比對 分析出某種疾病與答哪些基因具有相關性分析 比如說gwas分析 外顯子組測序就是通過基因晶片捕獲外顯子區域的序列 或者採用引物擴增的方式捕獲外顯子序列 利用二代測序對靶標外顯子測序並分析
用plink 做gwas分析,如何去除具有兩個等位基因的位點
2樓:眼睛心裡青
人類基因組計劃(humangenomeproject,簡稱hgp)hgp的研究內容hgp的主要任務是人類的dna測序,包括下圖所示的四張譜圖,此外還有測序技術、人類基因組序列變異、功能基因組技術、比較基因組學、社會、法律、倫理研究、生物資訊學和計算生物學、教育培訓等目的。1、遺傳圖譜(ge***icmap)又稱連鎖圖譜(linkagemap),它是以具有遺傳多型性(在一個遺傳位點上具有一個以上的等位基因,在群體中的出現頻率皆高於1%)的遺傳標記為「路標」,以遺傳學距離(在減數**事件中兩個位點之間進行交換、重組的百分率,1%的重組率稱為1cm)為圖距的基因**。遺傳圖譜的建立為基因識別和完成基因定位創造了條件。
意義:6000多個遺傳標記已經能夠把人的基因組分成6000多個區域,使得連鎖分析法可以找到某一致病的或表現型的基因與某一標記鄰近(緊密連鎖)的證據,這樣可把這一基因定位於這一已知區域,再對基因進行分離和研究。對於疾病而言,找基因和分析基因是個關鍵。
2、物理圖譜(physicalmap)物理圖譜是指有關構成基因組的全部基因的排列和間距的資訊,它是通過對構成基因組的dna分子進行測定而繪製的。繪製物理圖譜的目的是把有關基因的遺傳資訊及其在每條染色體上的相對位置線性而系統地排列出來。dna物理圖譜是指dna鏈的限制性酶切片段的排列順序,即酶切片段在dna鏈上的定位。
dna是很大的分子,由限制酶產生的用於測序反應的dn**段只是其中的極小部分,這些片段在dna鏈中所處的位置關係是應該首先解決的問題,故dna物理圖譜是順序測定的基礎,也可理解為指導dna測序的藍圖。廣義地說,dna測序從物理圖譜製作開始,它是測序工作的第一步。製作dna物理圖譜的方法有多種,這裡選擇一種常用的簡便方法——標記片段的部分酶解法,來說明圖譜製作原理。
3、序列圖譜隨著遺傳圖譜和物理圖譜的完成,測序就成為重中之重的工作。dna序列分析技術是一個包括製備dn**段化及鹼基分析、dna資訊翻譯的多階段的過程。通過測序得到基因組的序列圖譜。
4、基因圖譜基因圖譜是在識別基因組所包含的蛋白質編碼序列的基礎上繪製的結合有關基因序列、位置及表達模式等資訊的圖譜。在人類基因組中鑑別出佔具2%~5%長度的全部基因的位置、結構與功能,最主要的方法是通過基因的表達產物mrna反追到染色體的位置。基因圖譜的意義:
在於它能有效地反應在正常或受控條件中表達的全基因的時空圖。通過這張圖可以瞭解某一基因在不同時間不同組織、不同水平的表達;也可以瞭解一種組織中不同時間、不同基因中不同水平的表達,還可以瞭解某一特定時間、不同組織中的不同基因不同水平的表達。
您好想諮詢下細菌全基因組測序問題
代謝通路是kegg資料庫裡的pathway資料庫。可以通過全基因組 了編碼基因後,進行版pathway資料庫註釋,權從註釋結果的功能資訊中通過關鍵字查詢。一般都能找到。如果找不到,有可能是關鍵字不對或者基因組中沒有這樣的代謝通路功能基因。到底要不要去做全基因組測序 如果自己覺得有必要的話就去做一次,...
「人類基因組計劃」中的基因組測序工作是指測定什麼
人類基因bai組計劃的主要du任務是人類的dna測序，包zhi括以下的四張譜圖dao 1 遺回 傳圖譜答 ge ic map 又稱連鎖圖譜 linkage map 以遺傳學距離 在減數 事件中兩個位點之間進行交換 重組的百分率，1 的重組率稱為1cm 為圖距的基因 2 物理圖譜 physical m...
功能基因組是幹什麼的，什麼是功能基因組學
功能基因組的定義是 表達一定功能的全部基因所組成的dna序列，內 包括編碼基因容和調控基因。功能基因組 functional genomics 又往往被稱為後基因組 postgenomics 它利用結構基因組所提供的資訊和產物，發展和應用新的實驗手段，通過在基因組或系統水平上全面分析基因的功能，使得...