1樓:手機使用者
染色質免疫共沉
澱技術(chromatin immunoprecipitation,chip)也稱結合位點分析法,是研究體內蛋白質與dna相互作用專的有力工屬
具,通常用於轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。將chip與第二代測序技術相結合的chip-seq技術,能夠高效地在全基因組範圍內檢測與組蛋白、轉錄因子等互作的dna區段。
chip-seq的原理是:首先通過染色質免疫共沉澱技術(chip)特異性地富集目的蛋白結合的dn**段,並對其進行純化與文庫構建;然後對富集得到的dn**段進行高通量測序。研究人員通過將獲得的數百萬條序列標籤精確定位到基因組上,從而獲得全基因組範圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的dna區段資訊。
chip-seq測序後該做哪些生物資訊學分析
2樓:匿名使用者
高通量資料型別主要包括基因晶片和基因測序,我估計你想知道的是具體的內容。
具體的內容其實是指的高通量測序技術的應用,例如microarray,rna-seq,exome-seq,target-seq,whole-genome-sequencing,巨集基因組,16s rna,microrna,lncrna測序等。
研究的問題就更五花八門了,像現在精準醫療的概念很火,主要是以基因測序為入口,後面的應用,例如產前診斷,孕前診斷等,甚至像親子鑑定,腫瘤靶標等都可以通過生物資訊學的分析手段來搞定。
生物資訊分析分為幾個層次,第一個層次基本上就是用別人做好的成熟軟體,直接分析出你要的結果,再深入就是你會根據問題找到更合適的一些軟體或者模組,自己組建一些分析流程,包括自己寫一些輔助的程式指令碼,更深入的層次就是市面上沒有符合你要求的軟體或者統計演算法,你依據自己的需求,定製自己的分析過程,自己從頭開始寫基礎程式,寫統計演算法,寫模型等。到了這個程度就沒有那麼多限制了,主要比的是個人的思維想法以及眼界開闊程度。
現在也很多生物資訊的分析方法應用在大資料的各個領域。本質是各種統計思維方法的實現,找出特定的模式結果。
3樓:匿名使用者
首先進行質控過濾得到clean data;然後進行peaks calling,找出peaks;最後對這些peaks進行註釋。
高階分析包括peaks的富集等等等等
chip-chip和chip-seq有什麼區別
4樓:奔跑的窩牛的家
染色質免疫共沉澱copy技術(chromatin immunoprecipitation,chip)也稱結合位點分析法,是研究體內蛋白質與dna相互作用的有力工具,通常用於轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。將chip與第二代測序技術相結合的chip-seq技術,能夠高效...
5樓:匿名使用者
染色質bai免疫共沉澱技術(chromatin immunoprecipitation,duchip)也稱結合位點分析法,是研zhi究體dao內蛋白質與dna相互作用的有力工具,版通常用權於轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。將chip與第二代測序技術相結合的chip-seq技術,能夠高效...
辰砂的基本介紹,鋯鑽的基本介紹
辰砂又稱硃砂 丹砂 赤丹 汞沙,是硫化汞 hgs 礦物。含汞86.2 是鍊汞最主要的礦物原料 其晶體可作為鐳射技術的重要材料。還是中藥材,具鎮靜 安神和殺菌等功效。中國古代用它作為煉丹的重要原料。過去以產在辰州 今湖南沅陵等地 的品質最佳而得名。晶體屬三方晶系,與等軸晶系的黑辰砂成同質多象。常呈菱面...
怎麼介紹水泵,潛水泵的基本介紹
哈哈,你可能是某個泵廠的銷售 去向電廠介紹突出以下幾點 1 過往的使用業績,一般公司都會做一張業績表,在哪哪使用過同型別的泵,執行工況和你這裡也差不多,使用下來到現在沒有出現過什麼問題等等都是你可以說的。2 可靠性。電廠可能更在乎裝置的可靠性而不是在乎泵的 當然電廠的技術及採購也不是傻瓜,他們自己會...
入黨個人基本情況介紹,入黨個人基本情況
思路 先介紹自己,再寫自己的經歷,再寫申請原因。入黨個人情況介紹範文如下 我叫唐戀,1991年出生於北京市大興區的一個普通農民家庭,2005年6月在大興區第五中學加入了中國共青團,並於2009年10月向黨組織遞交了入黨申請書。現在就讀於首鋼工學院經濟管理系營銷092班。我志願加入中國共產黨,成為一名...