1樓：匿名使用者
如何利用kegg定位基bai因屬於哪du個代謝通zhi路代謝通路：目前在通路資料庫(pathway database) 中代
dao謝通路是建
內立得最好的，有容大約90個參考代謝途徑的圖形。每個參考代謝途徑是一個由酶或ec號組成的網路。
利用如下方法可通過計算機構建出生物體特有 的代謝通路：
先根據基因的序列相似性和位置相關性確定基因組中酶的基因。
然後合理地安排ec號。
最後將基因組中的基因和參照通路中用ec號編號的基因產物 結合起來。
kegg分析的時候，通路富集到的基因只有2個，結果可靠麼
2樓：匿名使用者
代謝通路：目前在通路資料庫(pathway database) 中代謝通路是建立得最好的，有大約90個參考代謝途徑的圖形。每個參考代謝途徑是一個由酶或ec號組成的網路。
利用如下方法可通過計算機構建出生物體特有 的代謝通路：
先根據基因的序列相似性和位置相關性確定基因組中酶的基因。
然後合理地安排ec號。
最後將基因組中的基因和參照通路中用ec號編號的基因產物 結合起來。
轉錄組測序得資料怎麼判斷kegg富集顯著性
3樓：匿名使用者
轉錄組bai測序得資料怎麼判斷dukegg富集顯著性
提取樣zhi品總rna後，用帶有oligo（dt）的磁dao珠富集真核生版物mrna（若為原核生物，則用權試劑盒去除rrna後進入下一步）。加入fragmentation buffer將mrna打斷成短片段，以mrna為模板，用六鹼基隨機引物（random hexamers）合成第一條cdna鏈，然後加入緩衝液、dntps、rnase h和dna polymerase i合成第二條cdna鏈，在經過qiaquick pcr試劑盒純化並加eb緩衝液洗脫之後做末端修復、加a並連線測序接頭，然後用瓊脂糖凝膠電泳進行片段大小選擇，最後進行pcr擴增，建好的測序文庫用illumina hiseq? 2000進行測序。
如何對一組基因做訊號通路分析
轉錄組測序得到的完整cds區可信嗎
天體生物學，指研究天體上存在生物 的條件及探測天體上是否有生物存在的學科。地外生物學，又稱外空生物學，在天文學中，是研究太陽系除地球外其他行星及其衛星上和其他恆星的行星系上可能存在生命現象的理論，以及 探測方法和手段的交叉學科。天體生物 學 英文 astrobiology 指研究天體上存在生物的條件...
轉錄組測序裡面的基因覆蓋度怎麼來的
轉錄組測序是bairna水平測序,相當於 dudna水平的基因組測zhi序,是一個框dao架。表達譜回主要研究的是基因表達量的變答化,上調或下降。先要有轉錄組或是基因組才可以做表達譜,否則沒有ref做參考。轉錄組測序和表達譜其實都是通過高通量測序技術進行的,轉錄組測序主要是針對沒有參考基因組 即基因...
轉錄測序中的nrntswissprotcogkegggo分
nr庫屬於非冗餘蛋白序列資料庫，是ncbi官方的蛋白序列資料庫，資料 於genpept swissprot pir pdf pdb以及ncbi refseq，是預設的蛋白比對資料庫。nt資料庫是美國國家生物技術資訊中心ncbi官方的核酸序列資料庫，nt庫屬於非冗餘核酸序列資料庫,資料 於genban...