1樓：
差異表達基
來因分析是根據表源型協變數（bai
分類變數）鑑定組du
間差異表達，它zhi屬於監督性分類的一dao種。在鑑定差異表達基因以前，一般需要對錶達值實施非特異性過濾（在機器學習框架下屬於非監督性分類），因為適當的非特異性過濾可以提高差異表達基因的檢出率、甚至是功效。r分析差異表達基因的library有很多，但目前運用最廣泛的bioconductor包是limma。
鑑定差異表達基因是表達譜晶片分析pipeline中必須的分析步驟。差異表達基因分析是根據表型協變數（分類變數）鑑定組間差異表達，它屬於監督性分類的一種。在鑑定差異表達基因以前，一般需要對錶達值實施非特異性過濾（在機器學習框架下屬於非監督性分類），因為適當的非特異性過濾可以提高差異表達基因的檢出率、甚至是功效。
r分析差異表達基因的library有很多，但目前運用最廣泛的bioconductor包是limma。
如何根據rpkm值求差異表達基因
2樓：匿名使用者
差異表達基因分析是根據表型協變數（分類變數）鑑定組間差異表達，它屬於監督性分類的一種。在鑑定差異表達基因以前，一般需要對錶達值實施非特異性過濾（在機器學習框架下屬於非監督性分類），因為適當的非特異性過濾可以提高差異表達基因的檢出率、甚至是功效。r分析差異表達基因的library有很多，但目前運用最廣泛的bioconductor包是limma。
鑑定差異表達基因是表達譜晶片分析pipeline中必須的分析步驟。差異表達基因分析是根據表型協變數（分類變數）鑑定組間差異表達，它屬於監督性分類的一種。在鑑定差異表達基因以前，一般需要對錶達值實施非特異性過濾（在機器學習框架下屬於非監督性分類），因為適當的非特異性過濾可以提高差異表達基因的檢出率、甚至是功效。
r分析差異表達基因的library有很多，但目前運用最廣泛的bioconductor包是limma。
差異基因分析pvalue，fdr是怎麼計算的
3樓：迷途崽崽
在利用rna-seq資料比較分析兩個樣品中同一個基因是否存在差異表達的時候，一般選取兩個標準：
i）foldchange
foldchange，很容易理解了。就是兩樣品中同一個基因表達水平的變化倍數。可以用rpkm值來計算，關於rpkm的計算方法，請參考 ii）fdr校正後的p-value，即q-valuefdr值的計算方法如下： 1）對每個基因進行p-value的計算 假設觀測到基因a對應的reads數為x，已知在一個大文庫中，每個基因的表達量只佔所有基因表達量的一小部分，在這種情況下，p(x)的分佈服從泊松分佈。已知樣本一中唯一比對到基因組的總reads數為n1，樣本二中唯一比對到基因組的總reads數為n2，樣本一中唯一比對到基因a的總reads數為x，樣本二中唯一比對到基因a的總reads數為y，則基因a在兩樣本中表達量相等的概率可由以下公式計算： 轉錄組資料中rpkm代表什麼 4樓：匿名使用者 轉錄組資料中，rpkm是reads per kilo bases per million reads的縮寫，代表每百萬reads中來自於某基因每千鹼基長度的reads數。 轉錄是遺傳資訊由dna轉換到rna的過程。作為蛋白質生物合成的第一步，轉錄是mrna以及非編碼rna（trna、rrna等）的合成步驟。是遺傳資訊從dna流向rna的過程。 即以雙鏈dna中的確定的一條鏈（模板鏈用於轉錄，編碼鏈不用於轉錄）為模板，以atp、ctp、gtp、utp四種核苷三磷酸為原料，在rna聚合酶催化下合成rna的過程。 如何計算cuffdiff中的fpkm值 5樓：末你要 fpkm與rpkm計算方法基本一致。公式如下： 其中c是map至該基因的外顯子上的片斷數，n是所有map至基因組的測序reads的鹼基數，l就是該基因外顯子鹼基全長。 在cuffdiff中，它會將同一組中所有的樣品試為同一**樣品處理，這就是為什麼同一組內如果有三個樣品的話，最終得到fpkm值並不是三個樣品單獨運算得到的fpkm值的平均值。 如何根據rpkm值求差異表達基因 6樓：匿名使用者 t檢驗會出現比較對的假陽性，可以用fdr校正一下。如果沒有生物學重複的話，建議用degseq。 也可以用edger包。read counts 需要聯絡給你做測序的公司，讓他們提供一下。如果有伺服器的話，亦可以自己跑一遍，不過比較費時間。 select case role when 0 then select name from tablea where dd 11 else select name from tableb where dd 11 end as name from post 就是使用 case 我沒有實驗過。如果有心在... 級別的公式 版 indirect a sumproduct a1 e5 a9 row a1 e5 檔次權的公式 offset a1,0,sumproduct a1 e5 a9 column a1 e5 1 把資料結構改為三列，分別是 工資資料 級別 檔次，並按工資大小排序 然後，用vlookup函式... 差異化管理，就是說在hr過程中，管理者不要過分地一味強調對員工 一視同仁 而要因人而異實行差異化的管理方式。對員工的管理，我們經常聽到的一句話就是 我對他們都是一視同仁 這句話聽起來似乎頗為公平 公正，實際上這句話根本就既不公平，亦不公正，因為一個企業的員工數多則上萬，少則幾位，無論上萬還是幾位，他...sql根據欄位不同值查詢不同表中的欄位
excel根據單元格的值在另表中查詢位置,並返回所在行號和列號
差異化管理的必要性，根據這個原則如何進行客戶分類管理呢