基因的上下游是怎麼分的， 10序列 10序列等的又是怎麼定義的

1樓：常用工程資料

基因的5'端為上游，3'端為下游。

在基因上，rna聚合酶的轉錄起始位點出的鹼基編號為0，向5'端方向，第一個鹼基編號為-1，第二個鹼基編號為-2……以此類推；同理，向3'端方向依次編號為+1、+2、+3……

好像沒有-10序列的說法吧？比方說「真核生物啟動子的tata盒子通常位於轉錄起始點上游-25至-30區域」，就是表示「tata盒子（一段含有tataaa的序列）」位於轉錄起始位點向5'端數第25到第30個鹼基的區域。

2樓：樹舟矯又柔

基因探針是指能與特定核苷酸序列發生特異互補雜交,雜交後又能被特殊方法檢測的已知被標記的核苷酸鏈.

探針根據**與性質不同已分為基因組dna探針、cdna探針、rna探針、crna探針和人工合成的寡核苷酸探針等5類.**可以是pcr擴增而來,或反轉錄而來,或人工合成等等,再加上標記物,比如同位素、地高辛、生物素等,這就得到了基因探針.

由於設計探針時需要目的基因的序列,這樣才可以得到特異性較高的探針用於檢測.如果未知該目的基因序列,恐怕需要先將該序列進行測序.

怎樣獲取目的基因上下游的序列

3樓：匿名使用者

基因探針是指能與特定核苷酸序列發生特異互補雜交,雜交後又能被特殊方法檢測的已知被標記的核苷酸鏈.

由於設計探針時需要目的基因的序列,這樣才可以得到特異性較高的探針用於檢測.如果未知該目的基因序列,恐怕需要先將該序列進行測序.

如何查詢已知基因的上游及下游序列

4樓：贅牧恫斡

可以先**一下該基因的promoter上潛在的轉錄因子結合位點。這應該有專門的軟體可以分析。然後也可以做個轉錄因子晶片檢查。沒做過啊，只是看見文獻上有這麼做過。

5樓：匿名使用者

名字錯了當然沒關係，只要序列正確就能用，一般來說，上游引物是正義鏈5端開始序列，下游引物是反義鏈5端序列從5端開始到3端比對一下，鹼基順序沒錯的話可以用，換個名字而已。

基因序列的上游是指哪一端，是5`端還是3`端

6樓：楊風遊

對於典型的基因來說，基因上游指編碼鏈5'端位置。基因上游只是一個籠統的說法，一般包含啟動子。

基因序列的上游是指dna鏈中能與rna聚合本科結合的這一端，rna轉錄是沿著模板鏈的3`-5`進行是指單鏈，而dna是雙鏈且是反向的，所以不能把單鏈的方向和轉錄的方向混到一起。啟動子應該仍然是非編碼區序列。

7樓：壽向摩宜然

如何區分目的基因在啟動子上下游？

8樓：最全生物學知識

可以測序來區分的。在啟動子上游設計引物，進行測序。

但是一般目的基因都是在啟動子下游的，要不然沒法啟動翻譯的。望採納

怎麼研究基因啟動子上游的一段序列是不是基因表達的調控序列

9樓：匿名使用者

可以將序列克隆到體外進行表達，通過基因表達的量來進行判斷：

1. 首先將上游序列帶啟動子序列克隆到一些報告基因的載體中，例如luciferase的基因，首先觀察構建後，luciferase是否能夠表達。然後再通過突變或截短啟動子上游的區域，來觀察luciferase的表達強弱，以判斷是哪一段，甚至是哪幾個鹼基對下游基因的轉錄起到調控的作用。

用報告基因是比較簡單方便的辦法。

2. 如果目標基因的產物本身容易檢測，也可以直接將上游序列到目標基因全部克隆出來，在體外進行表達。方法同樣，是通過突變和缺失來驗證功能。

如果缺失或突變該段序列後，目標基因無法表達，則說明是相關，如果經過驗證後，表達水平沒有變化，則說明是無關的序列。

通常，報告基因檢測會簡單些，因為直接加入底物或者是熒光激發，就可以知道表達水平的變化。在目標基因的驗證上，通常會通過rt-qpcr檢視mrna水平，wb檢視蛋白水平的變化來確認這段序列的功能。